Moorrees和Gron提出目前国内外学者普遍认可的综合性诊断，即不仅仅考虑牙齿、功能、骨骼等原因，还要考虑患者个体的全身状况和心理状态，社会和个体的其他因素。因此正畸学诊断的目的就是列出患者存在的问题，并将它们简明扼要的叙述出来，综合分析各种可能的治疗方案。
正畸诊断应建立在各种检查的基础上，并对检查所发现结果进行综合分析，才能确定正畸诊断。个别检查结果必须反复核查，以保证检查的准确性和真实性，它包括最确切的检查，以及大量的资料。综合性诊断应该总结最重要的事实，而不是无意义的继发性症状。某些继发性症状可能与正畸治疗不相关。有经验的正畸医师能较快的认识到病例的问题，并且选择最适宜的检查手段，运用这些方法熟练的进行检查。收集足够的基础资料，是分析各种存在的问题，最后形成推理性诊断的先决条件。与正畸相关的检查分析内容一般有七类：病史、临床检查、功能性分析、模型分析、X线片检查、腭运动记录、电影摄影术、X线头影测量分析等。其中病史、临床检查、功能分析、X线片检查是常规检查，对个别病例必要时还应进行特殊检查，如腭运动记录、电影摄影术等。
计算机近几年已广泛运用到医学领域，也在正畸诊断中得到使用。它能够快速、精确的判断分析个别资料，可对不同资料的相关性进行评价，并指出所存在问题的特殊性，但计算机并不能代替医师的综合分析，仍然需要医师去说明和综合分析检查结果，确定治疗方案。
