涎腺多形性腺瘤p53基因突变的聚合酶链式反应--单股构型多态分析研究

作者:王洁 董福生 雍平 李荷香 任贵云  文章来源:现代口腔医学杂志 

2007-12-14 14:59:48         【博客】 【论坛】 【投稿】 【打印】 【关闭

  【摘要】 目的 检测涎腺多形性腺瘤中p53基因突变。方法 采用非同位素聚合酶链式反应--单股构型多态分析(PCR-S SCP)技术对涎腺多形性腺瘤进行研究。结果 14例多形性腺瘤中有11 例出现PCR-SSCP异常电泳带(阳性率78.6%)。突变部位分布在第5~8外显子,其中第5、 6、7、8外显子的阳性例数分别为2、6、7、3例。在11例阳性肿瘤中有2例肿瘤同时出现3对 外显子(第6、7、8外显子)异常;3例肿瘤同时出现2对外显子(第6、7和7、8外显子)异常。 结论 ①涎腺多形性腺瘤发生中p53基因的第5~8外显子均有突变, 其中突变频率最高的是外显子6和7;②在阳性的肿瘤中约有半数出现多位点突变。
  【关键词】 多形性腺瘤  基因  突变 p53  PCR-SSCP

  大多数上皮源性肿瘤p53基因点突变是最常见的突变方式[1, 2]。为确定涎腺多形性腺瘤中p53基因突变的方式和位点,应用非同位素PCR-SSCP方法对 多形性腺瘤进行研究。

材料和方法

  一、标本:取自近期手术切除的涎腺多形性腺瘤14例,正常腮腺组织2例。所有新鲜标本立即经-196℃液氮速冻15分钟,置-70℃冰柜存放。
  二、DNA提取:取100mg新鲜冷冻组织,剪碎后置研磨器内,加入1ml DNA提取液(100mM NaCl;10mM Tris-HCl;25mM EDTA;0.5%SDS),冰水中研磨组织成匀浆,吸入1.0ml Eppendrof管中,加入40μl蛋白酶K(10mg/ml)。50℃~55℃水浴4小时(或37℃水浴过夜)。取出Eppendrof管置4℃冰箱。加入等体积饱和酚,摇荡10分钟,离心5000rpm,5分钟。取上清液,加入等体积饱和酚/氯仿/异戊醇(25/24/1),振荡5分钟,离心5000rpm,5分钟。取上清液,加入等体积氯仿/异戊醇(24/1),振荡5分钟,离心5000rpm,5分钟。取上清液加入1/10体积的3mol/L醋酸钠,逐渐加入二倍体积的冰无水乙醇。出现白色絮状物后,吸出置另一干净 Eppendrof管内,加入少量80%乙醇,离心,倒掉乙醇,置4℃冰箱凉干。TE溶解,置-20℃冰 箱保存。
  三、聚合酶链式反应(PCR):①引物设计:p53基因点突变主要位于4个保守区,即外显子5、 6、7、8。4对引物分别扩增了含有易突变位点的p53基因的4个DNA片段。引物序列见附表。 ②PCR扩增:PCR反应体系(25μl)中模板DNA 2μl(300ng/μl),4×dNTP 2μl(2.5mM/μl),10×PCR缓冲液2.5μl(含MgCl 15mM/ml),引物P1和P2各0.5μl(86μg/μl),无菌三蒸水17μl。95℃水浴变性5分钟后加入Taq DNA聚合酶0.5μl(3U/μl),充分混匀,加矿物油(美国Sigma公司)1~2滴。DNA扩增仪(美国PE公司480型)内40次循环(94 ℃变性1分钟,55℃退火1分20秒,72℃延伸2分钟),反应完成后,取5μl PCR产物经1.5% 琼脂糖凝胶电泳鉴定扩增产物。

附表 p53基因PCR扩增引物序列
 
外显子 引物序列(5′→3′) 产物长度
5 P1
P2
TAC
ATC
TCC
GCT
CCT
ATC
GCC
TGA
CTC
GCA
AAC
GCG
AAG
CTC
A
A
150bp
6 P1
P2
GTC
CTC
TGG
AGG
CCC
CGG
CTC
CTC
CTC
ATA
AGC
GGG
ATC
CAC
  112bp
7 P1
P2
GTT
CTG
GGC
GAG
TCT
TCT
GAC
TCC
TGT
AGT
ACC
GTG
ACC
ATG
  110bp
8 P1
P2
TGG
CTC
TAA
GCA
TCT
TAG
ACT
TGC
GGG
TCC
ACG
CTG
GAA
GG
C
130bp

  四、单股构型多态分析(SSCP):取5μl PCR产物,加入 5μl SSCP上样液(95%去离子甲酰胺,20mM/L EDTA,0.05%溴酚蓝,0.05%二甲苯晴 蓝),混匀。98℃变性8分钟,冰水骤冷,立即上样进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(丙烯酰 胺:甲基丙烯酰胺=60:1),1×TBE为电泳缓冲液,50V,30mA恒电流电泳8~10小时,电泳 至溴酚蓝接近凝胶底部时结束。
  五、银染:凝胶揭下后置银染固定液(30%乙醇,10%乙酸)中固定4~12小时,30%乙醇洗2次,各30分钟;三蒸水漂洗3次;0.1%硝酸银染液染色30分;少许三蒸水洗涤;银染显色液(2.5%碳酸钠,0.02%甲醛)显色10分钟,直至条带清晰;终止液(1%乙酸)终止3分钟;少许三蒸水漂洗5分钟,封干保存,照像。

本新闻共3页,当前在第1页  1  2  3  

责任编辑:姚红祥  

上篇文章:人舌鳞癌裸鼠原位移植模型及其主要生物学特性的研究
下篇文章:腮腺切除术后面神经功能损伤