局部用药的目的是减少菌斑的形成或降低微生物的致病力，以利于牙周恢复健康。
碘仿甲硝唑糊剂是一种综合物，在接触创面或患处后逐渐解聚、溶解、释放出碘，因而保持了传统碘制剂的高效的杀微生物作用。同时因为糊剂中的碘可以缓慢释放，故而杀菌作用更持久；甲硝唑是治疗厌氧菌感染的有效药物，该药具有渗出性强，生物半衰期长。
同时它具有很好的成膜、粘合、水溶性、渗透性强、无毒等特点。6个月的临床观察表明碘仿糊剂+牙周治疗，在减少探诊深度和增加附着方面显著优于口服药+牙周治疗者。局部用药组探诊深度减少和附着增加≥2mm的位点显著优于对照组。应该特别提示的是，药物治疗不能长期使用，它只能作为辅助方法之一，局部用药不能完全取代机械治疗。
